垂水神社名称中的“垂水”意思是“从悬崖上流下来的水”。寺院位于千里丘陵的南端，地处山泉流淌的地势，供奉的垂水神自古以来就被当作水神来供奉。孝德天皇时期，当地领主有马君所供奉的神丰木入彦命（丰木入彦命的后裔）在遭受干旱的丰崎神社修建了排水沟。由于他从当地送水，为了表彰他的功绩，他被赐名为“垂水君”（Tarumi no Kimi），并建立了垂水神社。