1545年（天文14年）春天，该地区流行天花，虽然后来慢慢停止，但由于在这座神社祈祷的护身符的功效，受到了老百姓的崇拜。 。然而，在天正时代（约400年前）的动乱中，神社建筑被大火烧毁。此后，三谷之所内部发生了各种纷争，但通过将庄园内供奉的神灵集中供奉，庄园得以统一，纷争平息，并在现址上建造了神社建筑，作为庄园的正殿。这就是今天种川神社的由来。春天，这里约有 100 棵樱花树盛开，成为家庭游客的热门景点。